只要发票全在，把这些发票全部作废了（全部联次一起作废并完整保存好），重新开具，就没有事。如果中间有发票没了就不能作废，那是要受罚了。
发票从第二联（发票联）开始填了，应该是违法行为，因为《中华人民共和国财政部令》（[1993]第6号）明确规定，开具发票时要全部联次一次性开具发票，否则可以处1万以下罚款。
《中华人民共和国财政部令》（[1993]第6号）
第三十五条 违反本办法的规定，有下列情形之一的，由税务机关责令改正，可以处1万元以下的罚款；有违法所得的予以没收：
（一）应当开具而未开具发票，或者未按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性开具发票，或者未加盖发票专用章的；
（二）使用税控装置开具发票，未按期向主管税务机关报送开具发票的数据的；
（三）使用非税控电子器具开具发票，未将非税控电子器具使用的软件程序说明资料报主管税务机关备案，或者未按照规定保存、报送开具发票的数据的；
（四）拆本使用发票的；
（五）扩大发票使用范围的；
（六）以其他凭证代替发票使用的；
（七）跨规定区域开具发票的；
（八）未按照规定缴销发票的；
（九）未按照规定存放和保管发票的。
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