两者的主要区别是硬盘传输数据速度差别——SATA2机械硬盘的传输数据最大速度为3Gb/s，SATA3机械硬盘的传输数据最大速度可达6Gb/s。当然，这些都是理论数值，实际使用可能难以感受到如此大的差异。除此之外，两者在外观上没有差别，SATA3标准兼容于SATA2，即SATA3硬盘可连接到SATA2插座上；反之亦可。只是硬盘传输数据会按较低的标准运行。
