说影响得看情况,退火温度太高肯定会影响引物的结合效率的。但是,实际上,好的引物一般是上下游引物的退火温度比较接近。有时候,我们可能会祥源通过牺牲特异性的手段(当GC含量过高时,减少引物长度)来平衡两条引物的退火温度。困宴大
高的退火温度是不利于复性的,所以不会因为使模板复性而降低扩增效率,倒是可能因为影响引物结合而降低扩增效率。不过65度应该没什么问题。我还是觉得两条引物退火温度汪竖一致最重要!
在Tm值允许范搜返围内, 选择较高的复性温度可大大减少引物和模板间的非特亮闷异性结合, 提高PCR反应的特异性。复性时间一般为30~60sec,足以使引物与模敬漏弯板之间完全结合
但是如果到70℃的话都快到延伸的温度了,这也可能导致非特异的扩增。
应该不塌咐会。我做的一个PCR反应的引物的长度为70nt。退火温度为68.9。PCR的结果任此隐然很好。我使用的是pfu酶。
引物和模板的结合要比模板的正负链的复性要容易的多森衫厅。这时要控制复性的时间。我所用的时间是1min。
65-70℃没问题。只要产物正确,可以再扩增。