中心成立以来，以国家加强公共卫生体系建设为契机，确立了“人才兴业、科技兴业、质量兴业”的发展战略，全面推进学科建设和科技创新，加强单位文化建设，努力打造集预防医学科学研究和公共卫生技术管理与服务为一体的新型疾病预防控制机构，并取得显著成效。先后成功处置多起传染病爆发疫情和中毒等突发公共卫生事件，并在抗击“非典”及“5.12”汶川大地震、甲型H1N1流感和2010年抗洪救灾等防疫工作中作出了卓越贡献。
