利用识别特定蛋白的抗体，捕获与此蛋白相互作用的核酸。特定蛋白多半是能够与核酸结合的，转录因子，调控原件等等，而抗体可以是识别不同修饰的蛋白，例如乙酰化什么的，用于转录调控，表观遗传学研究等等
抗体挂到固相支持物上（磁珠或琼脂糖），制备亲和纯化柱
对细胞进行甲醛交联，固定蛋白与核酸的结合物
将蛋白核酸复合物抽提出来，再将染色质片段通过超声或酶解，打断成小片段
将此小片段加到制好的亲和纯化柱上孵育
将未结合物质洗去
将目标蛋白核酸复合物洗脱收集
蛋白酶K加热解交联
纯化核酸
根据需要进行qPCR或者是测序，芯片等
这个可以在百度上查到，这里写出来就太多了。做转录因子结合位点时用到的
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