一般在国内很多工程都是按合同来，要是有特殊条款及协议的话优先考虑特殊条款及协议。当然也有随着工程进展有上层领导商议拿出更合适的解决方案，您这里问题具体是什么不是很清楚，仅仅是主合同和附加协议的话，后签订的这个优先。希望对您有用！
签署文件合同上有排序先后的，如果没有，那一般照时间后面的为有效，哪份文件新哪份有效！
