依据地表水水域环境功能和保护目标，按功能高低依次划分：
Ⅰ类 主要适用于源头水、国家自然保护区；
Ⅱ类 主要适用于集中式生活饮用水地表水源地一级保护区、珍稀水生生物栖息地、鱼虾类产卵尝仔稚幼鱼的索饵场等；
Ⅲ类 主要适用于集。
水功能区采用两级区划，即：
1、水功能一级区分为保护区、保留区、开发利用区和缓冲区四类；
2、水功能二级区是在一级区划的开发利用区中，再进一步划分为饮用水源。
