PC104PLUS 是专为PCI总线设计的，可以连接高速外接设备。PC104PLUS 在硬件上通过一个3X40即120孔插座，PC104PLUS包括了PCI规范2.1版要求的所有信号。为了向下兼容，PC104PLUS保持了PC104的所有特性,也就是说PC104有的功能，PC104 Plus都有，而且PC104 Plus支持PCI总线，速度更快。
还有一个区别就是PC104 共有64个总线管脚，单列双排插针和插孔，P1：64针，P2：40针，合计104个总线信号，PC104也是因此而得名的，而PC104 PLUS是120个。
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