对于一个质量为m的颗粒(蛋白质或核酸等其他生物分子),当放在离心力场中,例如角转头中,受到一个离心力作用fc:
fc=m(1-vρ)ω2r
其中r为处于离心管中的颗粒到转头中心的距离。ω为角速度(弧度/s)(ω=(2π/60)×RPM),RPM为转头每分钟的转数。(1-vρ)为浮力因子,ρ为溶液密度,而v为偏微比容(mL/g),定义为一克干物质置于无限大体积的溶剂中时溶液体积的增量。一般认为v等同于1/ρp,ρp是颗粒的有效密度。如果ρp等于ρ,则没有净的力作用于颗粒上,这样的颗粒将不会沉降。颗粒的运动受到阻力(fr=fv)的影响,v是运动速度,而f为摩擦系数。当沉降速度达到稳定状态时,fr=fc,
fv=m(1-vρ)ω2r
变换一下方程,用场强去除速度,得到:
S=v/ω2r=m(1-vρ)/ f=M(1-vρ)/ fN
其中M为分子量,N为阿伏伽德罗数,即M=mN。S称为沉降系数,其单位为秒。