UMBRELLA公司，即伞公司，总部位于欧洲，受美国政府之托，研制生物病毒兵器，由威廉博士主持（生2中穿白衣服，后注射T病毒入自身者），生产工厂与研究设施都在美国俄勒冈州南部小城莱肯市郊外的一座别墅下（电影中这一点和游戏是一致的）。因为生化兵器T病毒泄露，最先是周围的动物感染，然后受感染的动物袭击了人类，而这些被受到感染的人类变成了丧尸，继续袭击别的人类。
莱肯市警察局派出了特种战术与拯救小队，《生化危机0》的搜索小队BRAVO前去侦察别墅周围的阿克雷森林地区，没想到BRAVO全队只有女队员瑞贝卡幸存。接着STARS再派出战斗小队ALPHA（包括队长威斯柯、队中精英克里斯、吉儿等。）小队去搜救BRAVO小队。
而其实威斯柯很早就进入UMBRELLA公司做观察员的工作，他和UMBRELLA公司的威廉教授有着紧密的联系，BRAVO与ALPHA小队只不过是被其作为病毒兵器的一个作战对象而已，目的就是为了搜集T病毒的实战效能，在全队被打乱，队长叛变的情况下，ALPHA小队的队员们要靠自己逃出生天。
威斯柯发现威廉在病毒研究方面是个杰出的天才，投奔新东家的想法，他与威廉商量好，先往自身注射G病毒，同时把吉儿与克里斯引来，为了达到这个目的，他还胁持了队员巴里的家人，威逼巴里为其所用，让巴里将吉儿诱到最终BOSS“暴君”所在的地方。为了完美无缺不留痕迹，威斯克让最终BOSS“暴君”在吉儿与克里斯面前将自己杀死，但威斯柯不是真正的死亡，而只是进入一种深眠状态，他这样做的目的是为了检验“暴君”的实战效能，以便于献给新的东家。而威斯柯没想到ALPHA小队的克里斯、吉儿击败了“暴君”，与巴里及胆小的直升机驾驶员布莱德还有BRAVO小队的唯一幸存者瑞贝卡一同生还。威斯柯的计划落了空。
这就是游戏生化危机1的情节。
生化危机2》
生化1的事件结束后，莱肯市并未受到大规模的病毒感染，导致整个城市全部感染的最大起因是威廉博士与UMBRELLA公司的争斗。UMBRELLA公司发觉无法控制威廉博士，因为威廉博士研制出了更加厉害的G病毒，原来他和STARS的队长威斯柯早就认识，两人想拿着新的G病毒去投奔新的东家，所以在生1里，威斯柯假装让最终BOSS“独裁者”将其杀死，再由博士注射能令他复活的药物。但是他们都低估了老东家UMBRELLA公司的手段。
UMBRELLA公司派出特别回收部队强抢G病毒，特别回收部队将威廉击成重伤，但威廉博士却不想自己的东西就这样被夺走，他往自己体内注射了G病毒，变成了怪物，杀死了特别回收部队的人员，只幸存了领队的汉克，这就是生2游戏中的那个“第四幸存者”模式的来由。而威廉博士就是生2中的BOSS，有三次进化。
正是因为这次抢夺，威廉进行自身注射变成了怪物，而针管里残余的G病毒被老鼠在城市里传播，就这样，噩梦开始了……
游戏生化2中出现了新角色警察新丁里昂与一代主角克里斯的妹妹克莱尔。里昂完全是个全新的角色，在别墅事件后，莱肯市到处都在出现各种奇异生物，而离奇死亡事件更是此起彼伏。莱肯市警局为了稳定当地人的恐慌情绪招募了一些全新警员，里昂就是其中一个。里昂联系了调任其前往的警员，然而却没有得到任何回音，于是他只身一人赴任了。
而克莱尔则是和上一代有联系，她是去找自己的哥哥：1代男主角克里斯。
同时威斯柯与威廉所效力的新组织也派出特工埃达·王（是个华裔MM哦）调查并取回G病毒，在这过程中和里昂相遇并相爱（典型好莱坞情节！）。最后被威廉教授的妻子（威廉博士的妻子在游戏中只是个配角，爱其丈夫，支持他的研究，所以盲目追随他，而变异后的威廉博士却要杀死自己的女儿，取回G病毒，可悲啊）击中从高处坠落，生死不明。
在这一个情节里，里昂因为埃达的死而生怨，把辛苦得来的G病毒样本扔掉了，而幸存的UMBRELLA特别回收部队领队汉克拾到了G病毒并且带回了UMBRELLA公司，这就为后续作品埋下了伏笔。
UMBRELLA公司不仅派出回收部队到威廉博士处抢病毒，同时还派出上一作中的最终BOSS“暴君”去抢夺威廉博士女儿雪莉脖子上项链里的另一个G病毒样本，这就是生2中的那个动作迟缓的大块头。（不知为何在生2中‘独裁者’的动作变得很缓慢）
此作还揭示了莱肯市警察局长布莱恩与UMBRELLA公司相互勾结的阴谋，正是他，收了黑钱，尽力掩盖UMBRELLA公司在莱肯市进行生化武器的研究与生产的真相。同时这个局长还是个变态狂，喜欢女性尸体，在生2中就是他杀死了莱肯市市长的女儿。
传说中的《生化危机1.5》
这儿还有一个不得不说的故事，在生2之前，有一个完成度达65%的生化危机游戏已经在测试，这就是传说中的生化危机1.5。
97年的E3大展上，CAPCOM一举公布了大量有关“生化危机续作”的细节资料。在当时人们看到的“生化危机”故事发生在第一作之后的几个月，女主角是一位叫作Elza Walker的大学生，本来想回家放松几天，却发现此时的莱肯市到处都充满了丧尸。CAPCOM方面为了使同屏出现更多的怪物，将丧尸们的多边形数尽量简化，因此该版本《生化危机》中的丧尸显得有棱有角十分粗糙。另外在该版本中还有一幢现代化大楼，这在后来并未出现。可以利用卷帘门隔离僵尸的设定，名为蟑螂人的怪物等这些让人极为期待的设定在后来都未出现。在这一被称为《生化危机1.5》的作品中，还有一个相当具有创意的换装系统穿上不同的服装不仅可以给人涣然一新的感觉，在其中还有一些诸如防弹衣等的设定可以提高玩家的防御力，另外各种服装还有诸如增加携带能力等功能，后来的《生化危机2》中也有这样一套装备，不过毕竟简单得多。
在此作里，生2中里昂遇见的黑人警察马宾与武器店老板都是重要的角色。主角的形象也与生2不尽相同，同时武器系统可以使用手榴弹等，但是“丧尸之父”三上真司对此作仍是不满，将这个已接近完成的游戏全部推翻重新制作。（敬业精神值得佩服啊！）
《生化危机3—最终逃脱》
游戏生3发生在生2前面24小时，但是结尾要缓于生2的结尾（因为生3的结尾莱肯市被核弹毁灭，而生2的结局里昂与克莱尔只是逃离了莱肯市。
这里需要记住的是：生3的故事与生2的故事几乎是同时进行的。不然就会觉得混乱，不同的是：里昂与克莱尔比起吉儿早一天脱离了莱肯市。
此作中生化危机1的漂亮的女主角吉儿MM再次登场。
这时的莱肯市已全部被G病毒感染，进行防卫的警察尽数被丧尸击溃。
UMBRELLA公司在G病毒全面感染莱肯市后，派了一队雇佣兵到莱肯市，美其名曰是为了挽救市民，其实是为了记录G病毒的作战效能及抹掉罪证。
而此时生1的男主角克里斯已前往欧洲UMBRELLA公司进行调查，吉儿只有一人脱出已变成鬼域的莱肯市，而她也全然不知里昂与克莱尔来到了莱肯市，与此同时，里昂他们也正在城市的另一边为了生存而战。
UMBRELLA公司美国分部在派雇佣兵记录G病毒的作战效能的同时，远在欧洲的UMBRELLA总部也投入“复仇女神”病毒计划的成果：追击者，对STARS小组的幸存者进击狙杀。生1中幸存的ALPHA小队直升机驾驶员布莱德就是在警察局前命丧它手。这家伙是游戏生3中最可恶也最难对付的敌人，同样也有三次进化，以第一形态最不好对付，在最高难度下，两发火箭弹才能令其暂停行动，三发才能击倒！（据说有人在最高难度其第一形态下用刀将其活活剐死，真XXX的变态！）
UMBRELLA公司的雇佣兵中并不是全都知情的，上面给来的任务是拯救市民，但是其中的有一些情报员，专门负责搜集G病毒作战效果，有阻挡搜集者格杀无论。游戏中名为“尼古拉”的白发者即是其一，冷酷又无情。
但即使是装备精良身经百战的雇佣兵也无法射过丧尸的攻击，连队长米哈依（一个勇敢的俄罗斯战士，笔者认为是生3中最有魅力的男角色）也战死了，只剩下那个小白脸雇佣兵卡洛斯与吉儿一起逃亡。
最后，在莱肯市废水处理厂，吉儿与卡洛斯一起逃出了莱肯市（有两个结局，一个是卡洛斯用直升机载着吉儿走，一个是生1中幸存的STARS的队员巴里驾直升机来救吉儿与卡洛斯。）而里昂与克莱尔早于他们乘坐UMBRELLA公司研究设施的电车逃离了莱肯市（生2的结尾情节），美国政府为了掩盖事情的真相，发射了核弹，将莱肯市从地面上抹去，死亡人数20万人
《生化危机—代号维罗尼卡》
在这一作里，CAPCOM将其移到了新的游戏主机世嘉DC上，画面得以突飞猛进。但整个游戏表现平平，没有何诱人之处。
一代主角克里斯去了UMBRELLA公司欧洲总部调查，其妹克莱尔从莱肯市逃脱三个月后，亦跟着他的踪迹闯入UMBRELLA巴黎分公司，被发现遭捕，克莱尔被关进南太平洋一个隔离的荒岛监狱。虽然很快就被释放，然而等待她的却是更大的危机。在途中，克莱尔碰到了一个17岁的少年斯蒂夫，他们一起来到了阿斯弗尔德家族的豪宅并遇见了阿尔弗雷德·阿斯弗尔德，他有一个失踪多年的双胞胎妹妹阿莉西娅。而UMBRELLA公司事实上就是由阿斯弗尔德家族所创立。
克莱尔和斯蒂夫希望借助运输机逃离，结果却在阿尔弗莱德的操纵下飞到了荒废的UMBRELLA南极工厂。在这里阿莉西娅复苏了，体内拥有T-维罗尼卡病毒的她拥有极高的能力，她召唤出大沙虫使克莱尔和斯蒂夫陷入了险境。另一方面，里昂通知克里斯说克莱尔现在正在南太平洋荒岛上。在这里他遇上了阿尔伯特·威斯柯。这位本应在生1的别墅中就阵亡的宿敌，他告诉克里斯克莱尔现在已经在南极，而他也正在寻找阿莉西娅。在南极，阿莉西娅对斯蒂夫进行了生化试验，临死前他对克莱尔表达了自己的爱意。最后克里斯和克莱尔打败了阿莉西娅并乘坐战斗机离开了南极试验基地。
这一代生化危机是公认的差强人意之作，游戏中阿莉西娅居然可以召唤怪物，变成了魔幻游戏，说白了，其风格更接近PS上另一大作《寄生前夜》。
但不管怎么说，《生化危机》系列开始走下坡路了。
《生化危机4》
这个难产的游戏已经发售，主角是生2中的里昂，他只身一人深入南美一个小村庄，救回总统的女儿。
没有了UMBRELLA公司，没有了病毒，这是一个挂羊头卖狗肉的游戏，生化系列中的人物一一登场，而生2中的女特工埃达·王并未在此作中与里昂续那段未了的情，capcom打算继续让大家无聊的等待下去。
在最新一代的《生化危机4》中，玩家将扮演《生化危机2》的男主角 里昂（Leon），里恩在本代中已成为美国政府的顶尖探员，为了执行搜索美国总统女儿的任务，深入欧洲的某个村落，遭遇到整村的狂暴村民，而陷入苦战。
里昂面对的不再是以往依照本能行动，无思考能力与智慧的僵尸，而是拥有人类智慧、能彼此沟通且集体行动的残暴村民们(好象是感染了变种病毒,是由游戏中的神甫还是什么邪教的教主开发的)，玩家在操纵单枪匹马的里恩时，将更能感受到生死交关的紧张与恐惧。
本游戏也是《生化危机》本传系列中首次完全 3D 化的作品，包括人物与场景完全由多边型所构成，彻底发挥了 NGC 主机的硬体效能，在景物方面，达成足以与先前静态 2D 背景相同匹敌的画面水准，而人物方面更是达成超越前代的细致描绘与生动演出
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