商品房和经济适用房都是颁发《中华人民共和国房屋所有权证》，在本质上是没有区别的，都是购房者拥有房屋所有权的合法书面凭证，其财产权利受国家相应法律法规的保护和规范。
只是在使用和交易方面就有不同了。对于已经住满5年的经济适用房，业主现在可以依照目前市场价格进行出售，但出售后业主需按房屋成交额的10%补交综合地价款。对于尚未住满5年的经济适用房，政策规定不允许按市场价格出售。shzyshange44
因此，确需出售此类经济适用房的业主，只能以不高于购买时的单价出售，并且只能出售给符合经济适用住房购买条件的家庭或由政府相关部门收购。
通常情况下为个人和国家按份共有，故又称为共有产权房，是具有回迁性质或安居性质的住房。上市交易的条件是：产证登记日期满5年， 并需要住房所在地的住房保障办公室开具可上市交易的凭证， 持该凭证到交易中心缴纳契税并换取新的产证后方可上市交易。
经济适用房当然有房产证，但房产证上有注明经适房，土地是国有划拨土地，而商品房是国有出让土地。
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