实时荧光定量pcr内参是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。
扩展资料:
PCR原理:
1、PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
2、PCR由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
③引物的延伸:DNA模板-引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链。每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
参考资料来源:百度百科—实时荧光定量PCR
1、实时荧光定量PCR内参:
在不同的PCR反应管中已定量的内参和引物,内参用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。在模板扩增的同时,内参也被扩增。
在PCR产物中,由于内参与靶模板的长度不同,二者的扩增产物可用电泳或高效液相分离开来,分别测定其荧光强度,以内参为对照定量待检测模板。
2、选择:内参一般是固定的,可以用实验室之前就有的。或者用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。
扩展资料
(1)内参在传统定量中的作用:
由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔PCR仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。
加入内参后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。
(2)内参对定量PCR的影响:
若在待测样品中加入已知起始拷贝数的内标,则PCR反应变为双重PCR,双重PCR反应中存在两种模板之间的干扰和竞争,尤其当两种模板的起始拷贝数相差比较大时,这种竞争会表现得更为显著。
但由于待测样品的起始拷贝数是未知的,所以无法加入合适数量的已知模板作为内参。也正是这个原因,传统定量方法虽然加入内参,但仍然只是一种半定量的方法。
参考资料来源
百度百科-实时荧光定量PCR
内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因,又叫看家基因,比如常用的GAPDH, actin。或者18s rRNA也可以。
如果内参表达量一致,说明你PCR的上样量一致,样本的质量也一致。如果出入很大,说明你的样本的浓度或者是质量有问题。测到的目的基因的表达量就不可靠了
内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因,又叫看家基因。
管家基因,具体可以咨询公司,也可以自己看文献,常用的有GAPDH,beta-actin和18srna,根据不同的来源选用不同的管家基因,比如GAPDH就被人诟病做癌细胞基因时超不准。。。