多数是用INS(惯性导航)和APS(水声导航)联合定位,加上航迹测绘和海图资料推算大致的舰艇位置。但是总会有积累误差,那个时候可以用卫星导航,无线电导航,星光导航甚至六分仪硬算方位来校正,最主要的还是靠天文导航来纠正,资料显示土鳖应该有基于海流数据库的新的导航纠正手段。其实潜艇出航是基于严谨的海图测绘,洋流测绘,海底地形测绘等一系列的水文测绘的基础上的,对海域的水文情况了解越详细,就越有利于潜艇的行动。潜艇花钱可以买,但是水文资料没人会卖给你,所以周边国家即使拥有了先进的潜艇,但是没有自己详细的水文海图资料,也无法发挥潜艇的战斗力,甚至严重限制了潜艇的活动范围。这也是为什么土鳖要驱赶美帝迫近的水文测量船,人家在摸你家门口的潜艇地图,当然人家的核鱼在水下也没少测绘,总之也是个斗智斗勇的事情。
潜艇主要是依靠惯性导航系统。惯与其它导航方式比较，其最为突出的特点是工作完全独立，它依靠自身的惯性元件进行导航，与外界任何参考物没有任何关系，所以隐蔽性能好，在军事应用上有着极其重要的意义。
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