温室辣椒连年栽培的施肥量比较大，容易发生肥害，因此要求深施肥，增大施肥的范围，减少肥害。另外，深施肥也有利于刺激辣椒根系的发育，诱导根系向土壤深层扩展，为连年栽培提供根系基础。施肥时，结合深翻地，将半数有机肥与钙镁肥等均匀撒到地面上，深翻入30厘米深的土层内。剩下的肥料于定植前在定植行位置开沟深施入20厘米深的土层内。
