你程序上就走的不对。如果你的病确实不能坚持工作，可以让医生开病假单，请病假若再得不到同意，那就是单位的事了。
而你就因领导不同意请假，就擅自旷工，这显然违反了单位的规章制度和劳动纪律，而《劳动法》有规定，年内旷工超过15天，单位就有权做出开除、辞退等一系列的惩罚，你并未说出旷工的天数，但照你的说法，那至少也是连续三天以上，那扣除工资就是正常操作。单位是依照规章制度在办事，所以，你的诉求是不可能有结果的。
您的情况可以申请劳动争议仲裁。
您因为生病需要请假，是否有医生开具的病假条？您请假是否按照规定有请假申请？/主要是指书面的证据？
您选择离职是否有书面的辞职告知？
公司 扣除您的工资的主要依据是什么？
您可以先与公司进行协商，看看公司是依照什么给您发的工资？
如有具体问题，可以进行探讨。
人在屋檐下，不得不低头！为了几千块的工资去打官司，一没有胜算，胳膊难扭过大腿！二旷工是你自己选择的，你在没有批假的情况下旷工，没有选择找上级领导，已经是你的过失了！
旷工就旷工了，没有必要因为这个事情和领导再吵架了，这样子对待你的职业生涯真的有点不负责的，我觉得你因为这种不开心的事情离职了就没有必要再追究下去了，工资这个事情估计不是那么容易搞得到的了
遇到这样的领导没有人情味，选择辞职是对的，这这样的领导手下工作不会愉快的，扣掉工资不要了，快点离开吧。
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