员工工作服可以开增值税专用发票进行抵扣。《国家税务总局关于修订〈增值税专用发.票使用规定〉的通知》（国税发〔2006〕156号）第十条规定，一般纳税人销售货物或者提供应税劳务，应向购买方开具专用发.票。商业企业一般纳税人零售的烟、酒、食品、服装、鞋帽（不包括劳保专用部分）、化妆品等消费品不得开具专用发.票。
