个人认为:按照你所给出的情况,即使过了劳动合同约定得了劳动期限,只要员工还在医疗期内的劳动合同就要相应顺延,当医疗期满后劳动合同即因合同到期而终止。在劳动者经过劳动能力鉴定确认有丧失劳动能力的情况下,应支付不少于其6个月工资的医疗补助费。至于经济补偿金,在合同终止后如果单位同意维持原劳动条件和该员工签订劳动合同,而该员工不同意续订的,可以不支付经济补偿金。