关于网站后台申请计算机软件著作权的问题

计算机软件著作权是向中国版权保护中心申请的，需要软件源代码，代码数量是源代码的前30页和后30页，每页50行，不能有空行（你可以在WORD里通过“查找与替换”，使用查找^p^p替换成^P来去掉空行）。如果代码总数不足60页的，提供全部代码。
版权保护中心是不会对你的软件代码进行反编译的，所以基本上你用什么代码去申请，基本上那边是不会进行实质审查，仅仅是形式上进行审查而已。你所担心的问题基本不会发生。
但实际如果有人对你的软件有侵权异议的时候，可能会对你的软件进行分析，使用他人的核心代码会成为你的著作权的权利漏洞（这个情况只存在你的软件大卖，或和别人的软件发生冲突，然后有人要搞你的时候发生，普通情况下是没问题的）。
在著作权的软件说明书（或使用手册）中，你需要将你的软件前台运行和后台操作做一份详细的说明，可以把操作的每一步截图下来加以说明。
接下来申请的必要文件也要准备齐全，比如在先填写并打印的申请书，权利人的身份证明材料，基于软件开发的形式（独立开发，委托开发，合作开发等等）提供相应的协议或合同，权利证明文件。
希望以上回答能帮到你，再有问题请留言。

一般网站系统软件是前台+后台一起申请的，因为后台的一些配置可能需要前台展现出来，测试的时候需要检测的。
HTML和CSS不能算作功能代码，所以不需要放到源码文件里面。网上找的只要占的比重不多，不是核心功能，并且修改过的就问题不大。