第一，Linux程序设计是指在Linux环境进行程序的设计开发,
这个是与Windows环境程序相设计对应的，也就是说你设计的程序目标是运行在Linux环境的，当然，开发过程一般也都是在Linux环境中进行了。
第二，在Linux环境中，你不仅可以进行C语言程序设计，也可以进行C++/Java/Python/Lisp/PHP/Ruby/汇编等很多种语言的程序设计。
明确了上面两点，我想你就差不多明白了吧，差异一个是环境，一个是语言。
在Linux环境进行C语言程序设计和在Windows环境进行C语言程序设计在使用到系统调用(Linux中的概念)或者API(Windows里这么叫)时候，则可能出现不同，因为不同的系统提供不同的系统接口；但是，如果你的C程序没有使用到系统接口，而仅仅使用的是标准库等，这样就没有什么区别了，也就是说，你在Windows写的C程序，放到Linux中一样可以编译和运行，也就是代码级的可移植。
就像你所说的，程序设计都是写程序
好了，希望对你能有所帮助，有问题可以随时HI我
:)
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