我团员档案一直在初中，没转入高中，现在高中毕业了，要把团组织关系转入大学怎么办？

如果按照团章处理，你可能被团组织认为自行脱团。但你可以到初中的团组织去了解情况，如果他们没有办理你的脱团手续，请他们把你的团组织关系先转到高中，然后再请高中将团组织关系转到大学。关键在初中，你可以向初中团组织补交团费，这样他们可能会帮助你，同样也要向高中团组织补交团费，如果他们不要你补交就同意给你办理更好，但你要主动提出交，而且要想好一些没有转关系的理由，获得他们的支持与同情。如果没有办法转关系了，你想进步，马上在大学打入党报告，认真学习，积极参加学校的学生会工作，协助辅导员做好班级工作，可以在大学期间争取入党，团籍的事如果责任在自己就不要多说了，没有团组织关系，别人是不知道你曾经是否团员，除非你在其它表格中填写了。如其它表格填写了，入党申请时要说明的，不能隐瞒，也要讲出让人理解、同情的理由。供参考。

那你需要重新入团了，因为你团组织关系没有转到高中，那么就表明你有三年没交过团费，按照《中国共产主义青年团章程》团员部分第十一条“团员没有正当理由，连续六个月不缴纳团费、不过团的组织生活，或连续六个月不做团组织分配的工作，均被认为是自行脱团。团员自行脱团，应由支部大会决定除名，并报上级委员会批准。”
所以根据你的情况判断，你的团员身份应该是被取消了，组织关系已经丢失，需要重新申请入团。

如果你想要把团组织关系转入大学，你需要按照以下步骤进行：
1. 找到你的团员档案：如果你的团员档案一直在初中，你需要联系初中的团委会或团委老师，索要你的团员档案。
2. 联系高中团委会：在高中毕业后，你需要联系高中团委会，办理团组织关系转出手续。在办理手续时，你需要提供你的团员档案和相关证件（如身份证、录取通知书等）。
3. 联系大学团委会：在办理完高中团组织关系转出手续后，你需要联系大学团委会，了解大学团组织的加入方式和要求，并提交相关材料。
4. 完成团组织关系转入手续：在大学报到时，你需要携带相关证件和材料，完成团组织关系转入手续。
需要注意的是，不同学校的团委会可能有一些不同的要求和规定，你可以先联系相应的团委会了解具体情况。另外，如果你在初中的时候没有缴纳团费，你可能需要补缴团费才能办理团组织关系转出手续。