全民合同工是指经济体制改革后,企业和事业单位都有用人的自主权,对员工实行合同制(聘任制),全民单位在体制改革以后招来的职工.
全员合同工是计划经济时期，国有企业的职工分为固定工人、劳动合同制工人等多种类型，每种类型工人的权利义务不相同。1992年开始推行全员劳动合同制，即企业的职工不再区分为上述类型，而是全部与企业签订劳动合同，同工同酬，不再因身份的差异产生待遇差异。
简单的说两种没有什么区别，那都是过去计划经济时的名词了，现在基本没有也不用了。
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