一、参与方不同。就业协议是毕业生在校时，由学校参与见证的，与用人单位协商签订的，是编制毕业生就业计划方案和毕业生派遣的依据，实习协议是毕业生与用人单位明确劳动关系中权利义务关系的协议，学校不是实习协议的主体，也不是实习协议的见证方，实习协议是实习毕业生从事何种岗位、享受何种待遇等权利和义务的依据，对主体没有特殊要求。
二、内容不同。就业协议的内容主要是毕业生如实介绍自身情况，并表示愿意到用人单位就业、用人单位表示愿意接收毕业生，学校同意推荐毕业生并列入就业计划进行派遣。实习协议的内容涉及劳动报酬、劳动保护、工作内容、劳动纪律等方方面面，更为具体.劳动权利义务更为明确。
三、签订时间段不同。一般来说就业协议签订在前，实习协议订立在后，如果毕业生与用人单位就工资待遇、住房等有事先约定，亦可在就业协议备注条款中予以注明，日后订立劳动合同对此内容应予认可。
四、生效流程不同。就业协议是毕业生和用人单位关于将来就业意向的初步约定，对于双方的基本条件以及即将签订劳动合同的部分基本内容大体认可，并经用人单位的上级主管部门，高校毕业生和用人单位签字盖章承诺履行协议，高校不作为第三方。高校只在“有关信息及意见”一栏填写（或制作长条章加盖）学校的联系电话、邮箱、邮寄地址及相关意见等信息。一经毕业生、用人单位、高校、用人单位主管部门签字盖章，即具有一定的法律效应，是编制毕业生的就业计划和将来可能发生违约情况时的判断依据。实习协议是在毕业生进入用人单位前毕业生与用人单位双方协商签订，由用人单位加盖公章和毕业生亲笔签名，并注明生效时间和时限方可生效，只有毕业生入岗并且处在生效时间内才具有法律效应。
五、适用人群不同。就业协议是未毕业生和用人单位关于将来就业意向的初步约定。实习协议是已毕业或者即将毕业的毕业生和用人单位关于将来就业情况的具体约定。
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