某些基因中,完全去除内含子以后,仍然可以产生有活性的mRNA,但另一些基因就不是了,比如SV40T抗原基因,去除内含子后,成熟mRNA就不能够顺利运入胞质。所以内含子除与剪接机制密切相关外,还具有调控功能,与转运也相关。另外,有些基因的内含子恰是另一基因的外显子,这是内含子和外显子可变调控的一个很好的例子。
含有内含子的基因能转录出前体的RNA,再由内含子转录出的部分进行自我切割,得到成熟的mRNA,没有内含子就没有自我切割,没有成熟的mRNA
内含子分为自我剪接内含子,剪接体介导剪接内含子和酶促剪接内含子三类。一般认为内含子的作用是调控基因表达,但是目前对内含子的存在意义还是没有深入了解,但是要知道线粒体和叶绿体的基因里也是有内含子的。
内含子的意义在于转录mRNA的时候可以进行切割,这样子就保证了在进行转录的时候只转录DNA上有用的信息。