myeclipse 2015中使用J2EE6.0版本新建Web Project,为什么不自动生成web.xml配置文件？

这个没有影响，不过你也可以手动添加web.xml这个文件还是可以按照以前的配置。不过，从servlet 3.0(还是2.x？记不清楚了)，就不用配置web.xml，直接在代码中注解，这是新特性。所以这也是为什么你的项目没有自动生成web.xml的原因。

下面是一个简单的示例：
@WebServlet(urlPatterns = {"/simple"}, asyncSupported = true,
loadOnStartup = -1, name = "SimpleServlet", displayName = "ss",
initParams = {@WebInitParam(name = "username", value = "tom")}
)
public class SimpleServlet extends HttpServlet{ … }

如此配置之后，就可以不必在 web.xml 中配置相应的 和 元素了，容器会在部署时根据指定的属性将该类发布为 Servlet。它的等价的 web.xml 配置形式如下：

ss
SimpleServlet
footmark.servlet.SimpleServlet
-1
true

username
tom



SimpleServlet
/simple


具体你可以参考IBM的链接：（这里讲的很详细，请务必看看）
http://www.ibm.com/developerworks/cn/java/j-lo-servlet30/#major3

myeclipse 2015中使用J2EE6.0版本新建Web Project会自动在WebRoot创建web.xml的，如果没有看到，可以刷新一下就可以看到了。
在myeclipse 2015中创建web 工程：
1、点击file->new->web project
2、输入工程名称，选择工程目录（不要和其他工程放一起）javaEE和java、JSTL选择最新版本，Target runtime选择Apache Tomcat v8.0，若没有配置点击add new runtime进行配置。
3、选中工程目录，点击Manage Deployment，为工程配置Apache Tomcat 8.0 server
4、点击add, 然后点击finish，OK完成
5、右键点击servers下的Tomcat v8.0 server at localhost，左键点击start，运行没有出现错误信息，且为started状态即为启动成功