市公安局共设出入境管理局、车辆管理所等12个内设机构。下辖治安支队、交警支队、户政支队等17个一线部门和龙沙公安分局、建华公安分局、铁锋公安分局、富拉尔基公安分局、昂昂溪公安分局、梅里斯公安分局、碾子山公安分局。
其中,出入境管理局负责中国公民出入境、往来港澳、台湾地区、外国人入出境和在中国境内的管理等事务;车辆管理所负责全市机动车牌证发放和驾驶人考试、发证工作,开展全市机动车定期检验和驾驶证定期审验工作,管理全市机动车及驾驶员档案等工作;治安支队负责对行业场所、涉枪涉爆单位,负责公务用枪管理、危爆物品、剧毒化学品和放射性物品的管理,负责全市限制养犬工作的管理等工作;交警支队负责全市城乡道路交通指挥、维护道路交通秩序、处理交通违章,负责城镇道路交通设施、交通标志、交通标线、停车场(站)等基础管理设施的设置与管理,负责全市道路交通事故的处理工作,负责城区内路面交通巡逻与管控,查处交通违法行为,负责全市交通安全法制教育和交通安全宣传、指导驾驶员教育管理工作;户政支队负责全市常住人口、集体户口管理及外来人口落户审批工作,负责全市居民身份证管理工作、审验居民身份证制作手续等工作。