76 柯南VS怪盗基德
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
174 二十年的杀意 新佛尼号连续杀人事件
219 被召集的名侦探!工藤新一VS怪盗基德
309 接触黑色组织(交涉篇)
310 接触黑色组织(追踪篇)
311 接触黑色组织(决死篇)
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重谜案(非常精彩)
425 黑色冲击!组织魔爪伸来的瞬间
490 服部平次VS工藤新一 滑雪场的推理对决(两人初中时的推理对决)
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
521 杀人犯 工藤新一
522 新一的真实身份与小兰的眼泪
523 真正想问的事
616 福尔摩斯的默示录(名侦探的弟子)
617 福尔摩斯的默示录(Love is 0)
618 福尔摩斯的默示录(撒旦)
619 福尔摩斯的默示录(Code break)
620 福尔摩斯的默示录(草场女王)
621 福尔摩斯的默示录(0 is Start) (新一向兰表白)
651 柯南VS平次 东西侦探推理对决