协议是有效的，有法律保障。 依照《婚姻法》第十九条“夫妻可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或部分各自所有、部分共同所有。约定应当采用书面形式。”的规定，该房子属复婚前男方的婚前财产，可以通过协议约定归女方（虽然没有房产证，但有使用权等权益，也是一种财产权益）。
这栋房子既然无产权证，那么你们是没有权利处分的，协议归谁所有是不可以的
