显微镜只是把微小的物体放大了而已，看到的是物体的表面图像， 而非实质。
任何物体的实质是由原子或者分子构成，原子和分子用显微镜是看不见的，必须用电子显微镜。电子显微镜的原理和普通的显微镜不同，电子显微镜利用的是电信号物理成像，而非人眼直接观察到。普通显微镜利用光学原理。 如果更细微的讲，还可以把物体实质讲的更细微到电子、质子、中子等。这些都是普通显微镜看不见的，利用电子显微镜间接物理成像，呈现在荧屏上。
用显微镜看到的粒子与人眼看到的物体，其原理是一样的，利用光学原理看见的。
而，电子显微镜利用的就不是普通的光学原理了。
表面图象，粒子内部的结构是靠实验进行对核轰击得来的。很人眼看物体一样。
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