员工旷工的合理处理方式：第一次旷工，通过口头或书面警告，让本人认识到错误的严重性并且责令反省；第二次旷工，以全公司通报批评的方式警示本人及其他员工，并由主管领导进行谈话，记大过处分；第三次旷工，开除或劝退。
法律分析
员工旷工多次的，公司可以根据情况做辞退处理，辞退流程：一、确定合法的辞退依据；二、通知被辞退人员相关情况，并出具解除劳动合同通知书；三、按离职要求办理离职手续，向劳动者出具离职证明、住房公积金等相关手续，结清工资。离职证明，是用人单位与劳动者解除劳动关系的书面证明，是用人单位与劳动者解除劳动关系后必须出具的一份书面材料。人事部应以必须的格式写明离职员工的受雇日期、职位及其离职原因以及开证明的日期，且必须盖单位公章而且必须是原章，还应注意的是，离职证明复印无效；四、给劳动者办理社保停缴等手续，并在人事台帐上进行备注。员工连续旷工达到一定天数或累计旷工达到既定天数的用人单位是可以根据公司章程辞退员工的。
法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》
第三十九条 劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反用人单位的规章制度的；（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；（六）被依法追究刑事责任的。
第五十条 用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
员工旷工通常都是按照正常工资的扣除，同时，可以根据厂规予以开除，在开除前，只要结清员工的工资就行
按用人单位依法制定的规章制度处理
法律规定规章制度得依法制定
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