对于销方单位来说没有什么区别，开专用发票和普通发票都是按同样税率计算销项税。
对于购方单位来讲，如果是一般纳税人你就开增值税专用发票，对方单位不是一般纳税人你就开普通发票，因为税务局一般会限定你们单位领用增值税专用发票的数量。
区别是：如果是一般纳税人取得你们开的专用发票对方就可以抵扣增值税，你们要是开普通发票（除农产品外）对方就不能抵扣增值税，而对方单位不是一般纳税人时无论取得何种发票都不得抵扣增值税，所以你们给他开普通发票就可以了。
请参考
增值税专用发票与增值税普通发票有何区别？
普通发票和增值税发票是两种相对应的发票，大部分情况下我们拿到手的是普通发票，若是开增值税发票，需要多缴纳一笔费用。这两种发票有什么区别？
你知道吗
开 么？
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