黑客帝国看不懂啊。

楼主的说法完全错误！！！楼主应该先去把黑客帝国的1、2部再重新看2、3遍。其中有个镜头，就是尼欧吃下药后复活的情景，他的实体生活在机器城市里，然后他把身上的插头都拔下来。他的旁边还有一大堆像“蛋”一样的东西，每个蛋里面生活着一个人，但这些人是处于昏迷状态，他们的思想被接上了母体（也就像墨菲斯他们，复活以后还能插插头进入母体）只有吃药才能使他们在真实世界苏醒。所以尼奥是人！从头到尾都不是程序！黑客帝国里出现的程序只有这些：祭师、守护天使（那个中国人）、梅洛宾杰斯（那个法国人）和他的老婆、手下们（如双胞胎、火车人等）、电脑人、史密斯。

第一部：
在矩阵中生活的一名年轻的网络黑客尼奥(基努·里维斯）发现，看似正常的现实世界实际上似乎被某种力量控制着，尼奥便在网络上调查此事。而在现实中生活的人类反抗组织的船长莫菲斯，也一直在矩阵中寻找传说的救世主，就这样在人类反抗组织成员崔妮蒂(凯莉·安·摩丝)的指引下，两人见面了，尼奥也在莫菲斯的指引下，回到了真正的现实中，逃离了矩阵,这才了解到，原来他一直活在虚拟世界当中，真正的历史是，在20XX年，人类发明了AI(人工智能)，然后机械人叛变，与人类爆发战争，人类节节败退，迫不得已的情况下，把整个天空布满了乌云，以切断机械人的能源(太阳能)，谁知机械人又开发出了新的能源---生物能源，就是利用基因工程，人工制造人类，然后把他们接上矩阵，让他们在虚拟世界中生存，以获得多余的能量，尼奥就是其中一个，并被训练成一个厉害的黑客，与其他黑客的不同之处，让莫菲斯也更加肯定他就是救世主，就在这个时候，人类反抗组织出现了叛徒，莫菲斯被捕，尼奥救出了莫菲斯，但在逃跑过程中，被矩阵的“杀毒软件”特工杀死，结果反而让尼奥得到了新的力量，并复活了，真正的成为了救世主，并把在矩阵无所不能的特工杀死了（删除了）

全文 http://baike.baidu.com/view/6918.htm 有，楼主自己看吧太长

先去把黑客帝国的1、2部再重新看2、3遍。其中有个镜头，就是尼欧吃下药后复活的情景，他的实体生活在机器城市里，然后他把身上的插头都拔下来。他的旁边还有一大堆像“蛋”一样的东西，每个蛋里面生活着一个人，但这些人是处于昏迷状态，他们的思想被接上了母体（也就像墨菲斯他们，复活以后还能插插头进入母体）只有吃药才能使他们在真实世界苏醒。