答案C本题考查有关基因频率计算的相关知识。由题意知,种群中A的基因频率为40%,a的基因频率为60%。随机交配产生的后代中AA个体的百分比为40%×40%=16%,aa为60%×60%=36%,Aa为48%,A的基因频率为16%+48%/2=40%;自交产生的后代中AA个体百分比为16%+48%×1/4=28%,aa为36%+48%×1/4=48%,Aa为1/2×48%=24%,A基因频率为28%+1/2×24%=40%,所以C正确。