由于肝胆管结石的病因比较复杂，预防结石术后复发，需要从多方面入手。关键是外科手术要达到对肝胆管结石治疗的要求，不能遗留病灶和成石因素，其中主要的是胆道感染和胆汁淤滞。肝内胆管不能有狭窄或扩张，尽可能不行胆肠内引流术，因为任何胆肠吻合术，都会发生胆道流体力学的改变，发生胆道感染，都有再形成结石的可能。
近年应用中药“胆胰和胃冲剂”对肝胆管结石术后，防止结石复发取得一定效果。临床观察服药组患者胆汁成分有明显变化，胆红素及糖蛋白组分减少，胆酸增多，改变了成石胆汁的倾向，起到了防止胆石形成的作用。
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