一旦发现沙眼应及时治疗。治疗方法可选局部用药，常用眼药水有0.05～0.1利福平、10～30磺胺醋酰钠、0.1酞丁胺等，每日3～4次，晚上用眼膏1次，如0.5四环素眼膏、0.5金霉素眼膏等。全身用药因用药时间长和药量过大，易发生副作用，故很少使用。有时也可采用手术疗法。重度沙眼滤泡较多者，可用海螵蛸棒磨擦法及压榨法治疗，操作时应注意消毒，磨擦手法不可过重，切不可损伤角膜，病变严重而广泛时，可分期分阶段进行磨擦。此法只起辅助作用，仍要配合药物治疗。严重的沙眼并发症，如沙眼性上睑下垂、睑内翻倒睫、睑球粘连等，可以采取手术矫正。角膜血管翳严重者可考虑施行角膜缘血管电烙术。中医治疗本病，当内外兼施，轻症可以局部点药为主，重症则除点眼药外，宜配合内治，以疏风清热，活血通络为基本治法。
治疗沙眼主要是常规方法，利福平滴眼液局部滴眼，晚上红霉素眼膏涂眼，平时之一洗脸毛巾的消毒，避免重复感染和经久不治。
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