印花税是按主营业务收入的万分之3交还是按全部收入的万分之3交

都不是。

印花税以应纳税凭证所记载的金额、费用、收入额和凭证的件数为计税依据，按照适用税率或者税额标准计算应纳税额。

应纳税额计算公式：

应纳税额=应纳税凭证记载的金额（费用、收入额）×适用税率

应纳数额=应纳税凭证的件数×适用税额标准

扩展资料：

印花税根据不同征税项目，分别实行从价计征和从量计征两种征收方式。

（一）从价计税情况下计税依据的确定。

（二）从量计税情况下计税依据的确定。实行从量计税的其他营业账簿和权利、许可证照，以计税数量为计税依据。

下列凭证可以免征印花税：

（1）已经缴纳印花税的凭证的副本、抄本，但是视同正本使用者除外；

（2）财产所有人将财产赠给政府、抚养孤老伤残人员的社会福利单位、学校所立的书据；

（3）国家指定的收购部门与村民委员会、农民个人书立的农副产品收购合同；

（4）无息、贴息贷款合同；

（5）外国政府、国际金融组织向中国政府、国家金融机构提供优惠贷款所书立的合同；

（6）企业因改制而签订的产权转移书据；

（7）农民专业合作社与本社成员签订的农业产品和农业生产资料购销合同；

（8）个人出租、承租住房签订的租赁合同，廉租住房、经济适用住房经营管理单位与廉租住房、经济适用住房有关的凭证，廉租住房承租人、经济适用住房购买人与廉租住房、经济适用住房有关的凭证。

参考资料来源：百度百科-印花税

　　都不是，按照具体金额来。
　　印花税的税目，指印花税法明确规定的应当纳税的项目，它具体划定了印花税的征税范围。一般地说，列入税目的就要征税，未列入税目的就不征税。根据税目不同税率不一样。
　　万分之3的税率主要有：购销合同、建筑安装工程、技术合同三样。
　　应纳数额=应纳税凭证记载的金额（费用、收入额）×适用税率
　　应纳税额=应纳税凭证的件数×适用税额标准。
　　其中，购销合同按购销金额0.3‰贴花；建筑安装工程按承包金额0.3‰贴花、技术合同按所载金额0.3‰贴花。

按照合同约定的金额缴纳印花税。在印花税暂行条例中有规定。