《名侦探柯南》有关黑暗组织的集数分别在第几集？

主线剧情： 001云霄飞车杀人事件（组织） 043江户川柯南诱拐事件(父母知道变小) 048~049外交官杀人事件(平次登场，第一次恢复)
054电玩公司杀人事件（组织） 057，058福尔摩斯迷杀人事件(平次知道身份) 128黑衣组织10亿元抢劫事件
129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（组织） 170，171暗阁中的死角（新出登场） 176，177，178与黑暗组织的再会（组织）
188－－193危命的复活（新一，兰） 226，227格斗游戏的陷阱（朱蒂登场） 230，231谜一样的乘客（赤井登场）
258，259来自芝加哥的男子（詹姆斯登场） 269，270犯罪的纪念品（有提到警察局关于毛利的案卷被偷一事） 271，272紧急隐藏的省略（朱蒂）
277，278英语教师VS关西侦探（朱蒂） 284~285中华街雨中的似曾相识 286，287，288工藤新一NY事件（不用多说了吧）
307，308无声的证据（组织相关，下一集的引子） 309，310，311与黑色组织的接触（组织） 335，336东都显影所的秘密（有神秘人）
338，339 4辆保时捷（朱蒂和贝尔摩德假扮的新出发现哀） 340，341隐藏在厕所里的秘密（更多关于哀父母的消息，找到明美藏起来的录音带）
343，344便利店的陷阱（最后一段是小兰发现朱蒂藏的照片，怀疑朱蒂） 345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案（不多说了）
346，347寻找P股上的印记（上集案件的扫尾，关于哀拒绝证人保护计划的事） 385-387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场，小五郎受到怀疑，若不是秀一就挂掉了) 429--430无法回到从前的两个人(本堂)
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者 463 黑衣组织的影子 奇妙的照明 464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬 465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇） 467 坚不可摧的雪人（后篇） 484 黑色照片的行踪（前篇） 485 黑色照片的行踪（后篇） 491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘 493 红与黑的碰撞 疾呼 494 红与黑的碰撞 冥土 495 红与黑的碰撞 昏睡 496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒 498 红与黑的碰撞 扰乱 499 红与黑的碰撞 伪装 500 红与黑的碰撞 遗言 501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白 503 红与黑的碰撞 决死 504 红与黑的碰撞 殉职 507 卡拉OK房间的死角（前篇） 508 卡拉OK房间的死角（后篇）
还有些集案件本身没什么，其间就一两句话和组织的事有点关系或者哀的话暗藏玄机
130--131竞技场无差别胁迫事件(故事内容和主线情节无关，但灰原讲的一句话曾让广大柯南迷浮想联翩：“工藤君，也许你自己不知道，其实半个世纪前你就在组织的计划中了”。这究竟是怎么一回事？半个世纪前优作大概都没出生呢！看来只有等青山来解释了。)
222--224招致死亡的人鱼传说（人鱼小岛签名册有宫野志保的名字） 242元太的灾难（好像提到GIN是左撇子) 246--247网中的谜事件（哀和兰握手）
253－-254本厅刑事恋爱物语(本身案件无意义，不表。有两个值得注意的地方是，一是小兰在饭店里看到赤井秀一居然有似曾相识的感觉，二是柯南和新出合力扮演了高木警官，一个出身材和动作，一个出配音。望月以为，有可能就是从这集开始，柯南对新出的身份产生了怀疑。因为他注意到了新出超强的模仿能力。)
279--280迷宫的阴暗（这集哀说了很多话;主线情节只被带到了一点。博士应柯南的要求去克里斯的网站上查过信息。发现她就是美国已故大明星莎隆.宾亚德的女儿。在母亲的葬礼上，面对记者的追问，克里斯曾神秘的回答道：A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN.另外，有希子也出现在了莎隆的葬礼中，但是她的帽檐压的很低，所以美国的网站上显示当时并没有人认出有希子的身份，只是谣传说日本的前人气女明星也出席了葬礼。）
289--290迷惘森林中的光彦（上下集）（有提到哀对组织气味已经不敏感了。和沼渊已一郎是组织一员的事。） 309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追踪篇）311 与黑暗组织的接触（决死篇）339 四辆保时捷(后篇) 340 厕所里隐藏的秘密(前篇)
341 厕所里隐藏的秘密(后篇) 。（黑衣组织）345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重谜案。服部平次易容成新一，柯南易容灰原哀。与黑衣组织交手
400 持有疑惑的小兰。有新一（回忆）。第四次怀疑柯南身份425 黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间。又是黑衣组织（无语）472 工藤新一少年的冒险(前篇)
473 工藤新一少年的冒险(后篇)。新一小时候（这算不算？）490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决。平次和新一初次对决（初中）
491至504都是有关黑暗组织的。504集，赤井秀一是生是死？511 推理对决！新一VS冲矢昴。如题。冲史昴是黑衣组织成员？521 杀人犯，工藤新一
522 新一的真实身份与兰的眼泪523 真正想问的事 。柯南又一次变回新一。（这几集很精彩，千万别错过）
547 与犯人共度的两天(第一天)。柯南被挟成人质，不过有惊无险。
563 侦探团VS强盗团（骚乱）（回忆秀一潜入组织前与茱蒂分手。与脸上有烧伤、疑似秀一的人登场。茱蒂被卷入强盗案）
564 侦探团VS强盗团（沉默）（“伤疤男”自始至终没有说话，最后右手开枪救了柯南。少年侦探团知道茱蒂身份）
578 召唤危机的红色预兆（侦探团说道银行抢案中看到类似秀一的人物，柯南大吃一惊。FBI在寻找秀一；冲矢昴也出现在米花百货商厦）
579 黑与13的暗示（疑似秀一的男子和冲矢昴同时出现。商厦遭炸弹劫持，局势再次混乱，赤井之死遭疑）
580 紧迫黑色的时限（基尔被怀疑身份，琴酒准备让基安蒂狙击疑似秀一的人）
581 红色的摇摆目标（冲矢昴称组织为“笨狼”，对柯南似乎很了解，言语中好像对柯南传递了某些信息似的。“伤疤男”对着狙击枪轻蔑的一笑。贝尔摩德传达Boss指令，琴酒下令撤退，并似乎不再对基尔表示怀疑。“伤疤男”是否为真秀一被质疑）
616 福尔摩斯的默示录（名侦探的弟子）
617 福尔摩斯的默示录（Love is 0）
618 福尔摩斯的默示录（撒旦）
619 福尔摩斯的默示录（Code break）
620 福尔摩斯的默示录（草场女王）
621 福尔摩斯的默示录（0 is Start）（工藤新一第四次恢复，工藤新一第一次向小兰正面表白）
623 紧急事态252（后篇）（冲矢昴行为诡异，证明了他有极强的洞察力，身手也不凡。灰原再次对冲矢昴有组织感觉）
646（伪651） 幽灵旅馆的推理对决（前篇）（世良真纯登场，自称侦探，身份可疑）
647（伪652）幽灵旅馆的推理对决（后篇）（世良似乎对“新一”的名字有耳闻。之后转到小兰班上）
648（伪653）侦探事务所笼城事件（勃发）（世良来侦探事务所打听柯南信息，柯南感觉她可能很像自己认识的某个人。侦探事务所遭炸弹劫持，事态危急）
649（伪654）侦探事务所笼城事件（狙击）
650（伪655）侦探事务所笼城事件（解放）
651（伪656）柯南VS平次东西侦探推理对决（FBI的茱蒂、卡迈尔等人对世良有似曾相识的感觉。詹姆斯则一眼就认出世良是女生，显得更加可疑）

425蛮好看的，345也好看